凉山州科协内设机构：

普及部、学会部、办公室、民族科普工作队、青少年科技活动中心。

凉山州科协组织机构：

1959年8月21日，西昌专区科学技术协会筹备委员会成立，1959年底，西昌专区科学技术协会正式成立，1962年，撤销专区科委后，专区科协保留至“文革”中消失。

1980年2月28日，成立凉山州科学技术协会，归口州科委领导。1980年8月2日，州科协与州科委分设。1983年11月1日，凉山州科协党组正式成立。

1989年1月27日，批准成立凉山州青少年科技活动中心，为州科协下属科级（全额拔款）事业单位。

2004年6月9日，批准成立“凉山州民族地区科普工作队”。